MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 1

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008503	GAT	2	6	418	423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
2	NC_008503	TTC	2	6	449	454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
3	NC_008503	TTGCT	2	10	512	521	0 %	60 %	20 %	20 %	116326530
4	NC_008503	CAT	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
5	NC_008503	TGAAT	2	10	696	705	40 %	40 %	20 %	0 %	116326530
6	NC_008503	ATTT	2	8	715	722	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
7	NC_008503	T	6	6	827	832	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
8	NC_008503	T	6	6	839	844	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
9	NC_008503	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326530
10	NC_008503	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
11	NC_008503	CTTT	2	8	878	885	0 %	75 %	0 %	25 %	116326530
12	NC_008503	T	6	6	937	942	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
13	NC_008503	GGA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326530
14	NC_008503	TTGA	2	8	996	1003	25 %	50 %	25 %	0 %	116326530
15	NC_008503	T	6	6	1044	1049	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
16	NC_008503	TCT	2	6	1091	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
17	NC_008503	GTA	2	6	1127	1132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
18	NC_008503	CTT	2	6	1218	1223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326530
19	NC_008503	T	7	7	1252	1258	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
20	NC_008503	CAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
21	NC_008503	TCA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326530
22	NC_008503	TTTA	2	8	1402	1409	25 %	75 %	0 %	0 %	116326530
23	NC_008503	T	7	7	1528	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
24	NC_008503	GTTT	2	8	1554	1561	0 %	75 %	25 %	0 %	116326530
25	NC_008503	T	6	6	1645	1650	0 %	100 %	0 %	0 %	116326530
26	NC_008503	AAAG	2	8	1659	1666	75 %	0 %	25 %	0 %	116326530
27	NC_008503	AAACAA	2	12	1675	1686	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116326530
28	NC_008503	TGA	2	6	1766	1771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326530
29	NC_008503	CTTA	2	8	1787	1794	25 %	50 %	0 %	25 %	116326531
30	NC_008503	CTA	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
31	NC_008503	TTG	2	6	2001	2006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
32	NC_008503	CTC	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326531
33	NC_008503	GTT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
34	NC_008503	T	6	6	2178	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	116326531
35	NC_008503	GTTT	2	8	2194	2201	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
36	NC_008503	AGA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
37	NC_008503	CTTC	2	8	2330	2337	0 %	50 %	0 %	50 %	116326531
38	NC_008503	CGA	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326531
39	NC_008503	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
40	NC_008503	GTTT	2	8	2586	2593	0 %	75 %	25 %	0 %	116326531
41	NC_008503	TGA	2	6	2628	2633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
42	NC_008503	A	7	7	2654	2660	100 %	0 %	0 %	0 %	116326531
43	NC_008503	AGG	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
44	NC_008503	TGA	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
45	NC_008503	TTG	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
46	NC_008503	TCT	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326531
47	NC_008503	GGA	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
48	NC_008503	GTAA	2	8	3023	3030	50 %	25 %	25 %	0 %	116326531
49	NC_008503	CTA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326531
50	NC_008503	AAT	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
51	NC_008503	AAT	2	6	3157	3162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
52	NC_008503	TTG	2	6	3177	3182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326531
53	NC_008503	A	6	6	3184	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	116326531
54	NC_008503	AAG	2	6	3316	3321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
55	NC_008503	ATA	2	6	3391	3396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
56	NC_008503	TGA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326531
57	NC_008503	GAA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326531
58	NC_008503	GAG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326531
59	NC_008503	ACA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326531
60	NC_008503	ATT	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
61	NC_008503	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326531
62	NC_008503	TAT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326531
63	NC_008503	T	7	7	3933	3939	0 %	100 %	0 %	0 %	116326531
64	NC_008503	CAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
65	NC_008503	ATT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
66	NC_008503	CTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
67	NC_008503	ACG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
68	NC_008503	ACT	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326532
69	NC_008503	GAAAAA	2	12	4859	4870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116326532
70	NC_008503	A	6	6	4872	4877	100 %	0 %	0 %	0 %	116326532
71	NC_008503	ATT	2	6	4933	4938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
72	NC_008503	A	6	6	4989	4994	100 %	0 %	0 %	0 %	116326532
73	NC_008503	AC	3	6	4999	5004	50 %	0 %	0 %	50 %	116326532
74	NC_008503	AGC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326532
75	NC_008503	TGA	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326532
76	NC_008503	AAT	2	6	5160	5165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326532
77	NC_008503	TTGA	2	8	5166	5173	25 %	50 %	25 %	0 %	116326532
78	NC_008503	TA	3	6	5269	5274	50 %	50 %	0 %	0 %	116326532
79	NC_008503	AAG	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326532
80	NC_008503	CT	3	6	5296	5301	0 %	50 %	0 %	50 %	116326532
81	NC_008503	TAT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326532
82	NC_008503	T	7	7	5955	5961	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
83	NC_008503	CCA	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326533
84	NC_008503	T	6	6	5981	5986	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
85	NC_008503	T	6	6	5988	5993	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
86	NC_008503	TTC	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
87	NC_008503	TAT	2	6	6013	6018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
88	NC_008503	TAT	2	6	6052	6057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326533
89	NC_008503	TCT	2	6	6099	6104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
90	NC_008503	TTC	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
91	NC_008503	T	6	6	6122	6127	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
92	NC_008503	GTT	2	6	6145	6150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326533
93	NC_008503	T	8	8	6176	6183	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
94	NC_008503	AAAAT	2	10	6214	6223	80 %	20 %	0 %	0 %	116326533
95	NC_008503	GTC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326533
96	NC_008503	TTG	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326533
97	NC_008503	T	6	6	6296	6301	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
98	NC_008503	A	7	7	6317	6323	100 %	0 %	0 %	0 %	116326533
99	NC_008503	TAA	2	6	6331	6336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326533
100	NC_008503	TCAACG	2	12	6348	6359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116326533
101	NC_008503	T	7	7	6374	6380	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
102	NC_008503	T	7	7	6413	6419	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
103	NC_008503	T	6	6	6421	6426	0 %	100 %	0 %	0 %	116326533
104	NC_008503	GCTT	2	8	6435	6442	0 %	50 %	25 %	25 %	116326533
105	NC_008503	TTC	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326533
106	NC_008503	T	6	6	6543	6548	0 %	100 %	0 %	0 %	116326534
107	NC_008503	AGT	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326534
108	NC_008503	AAC	2	6	6721	6726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326534
109	NC_008503	TAA	2	6	6735	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326534
110	NC_008503	TTC	2	6	6783	6788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
111	NC_008503	TCT	2	6	6793	6798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
112	NC_008503	T	7	7	6803	6809	0 %	100 %	0 %	0 %	116326534
113	NC_008503	TCT	2	6	6866	6871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
114	NC_008503	AATC	2	8	6890	6897	50 %	25 %	0 %	25 %	116326534
115	NC_008503	AAG	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326534
116	NC_008503	TTC	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
117	NC_008503	T	7	7	6966	6972	0 %	100 %	0 %	0 %	116326534
118	NC_008503	GATT	2	8	7220	7227	25 %	50 %	25 %	0 %	116326534
119	NC_008503	TCA	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326534
120	NC_008503	TTTAAA	2	12	7314	7325	50 %	50 %	0 %	0 %	116326534
121	NC_008503	CTT	3	9	7337	7345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
122	NC_008503	A	6	6	7353	7358	100 %	0 %	0 %	0 %	116326534
123	NC_008503	CTT	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326534
124	NC_008503	AAAG	2	8	7425	7432	75 %	0 %	25 %	0 %	116326534
125	NC_008503	TC	3	6	7441	7446	0 %	50 %	0 %	50 %	116326534
126	NC_008503	GA	3	6	7450	7455	50 %	0 %	50 %	0 %	116326534
127	NC_008503	ATA	2	6	7459	7464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326534
128	NC_008503	TGG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326534
129	NC_008503	CTTTT	2	10	7577	7586	0 %	80 %	0 %	20 %	116326534
130	NC_008503	TTCA	2	8	7593	7600	25 %	50 %	0 %	25 %	116326534
131	NC_008503	CAG	2	6	8428	8433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326535
132	NC_008503	ATT	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326535
133	NC_008503	CTA	2	6	8457	8462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326535
134	NC_008503	ACG	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326535
135	NC_008503	ACT	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326535
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137	NC_008503	A	6	6	8599	8604	100 %	0 %	0 %	0 %	116326535
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.